Jon Steinar Kjøllesdal er gift med Marte Kjøllesdal, og de har tre barn i skolealder. Sammen med gode venner er de med i en menighetsplanting i Indre Østfold i regi av Kristent Fellesskap. Jon Steinar er iblant å se på Kanal 10 med bønn for landet, og har de siste ti årene ledet Nasjonalt Bønneråd, et samarbeidsforum for nasjonale og regionale bønneinitiativ i Norge. Han er teolog og samfunnsgeograf av utdannelse og brenner for et forvandlet Norge som forvandler nasjonene.